MEGA進化樹是一款分子進化遺傳分析軟件，用于進行分析遺傳學方面的研究，使用mega可以進行序列對比、進化樹的推斷、估計分子進化速度、驗證進化假說等操作，還支持通過NCBI進行序列的比對和數據的搜索，是一款簡單好用的軟件，就算你是新手使用起來也沒什么難度！


 

mega 使用教程

1、打開mega準備需要建樹的序列，并將序列保存為fasta格式。
2、點擊Align--Edit/built Alignment，選擇Create a new alignment，點擊ok。
3、打開fasta序列。
4、點擊Alignment –Align by ClustalW ，選擇所有序列，參數根據需求修改，選擇【默認】，點擊ok。
5、比對完成后，點擊Data –Phylogenetic Analysis，出現坐標箭頭指向的兩個按鈕。
6、點擊Phylogeny，有5個構建進化樹的方法，一般選擇MaximumLikehood(最大似然法)、Neighbor-Joining(鄰接法)和Minimum-Evolution(最小進化法)方法，在此選擇選擇Neighbor-Joining(鄰接法)建樹。
7、在Test of Phylogeny 選擇Bootstrapmethod; No.ofBootstrap replications 輸入2000; Mode/Method 核酸選擇Maximum Composite Likehood, 氨基酸序列選擇Poisson model; Rates among sites 選擇Uniform rates; Gaps/Missing Data Treatment 選擇Compeledeletion, 點擊Compute得到下面結果，根據自己的需求對樹進行修飾。
 

mega 特點

1、序列分析

系統發育推論
型號選擇
約會和時鐘
祖傳國家
選擇和測試
序列比對

2、統計方法

最大似然
距離方法
普通最小二乘
最大的簡約
復合似然
貝葉斯

3、強大的視覺工具

對齊/跟蹤編輯器
樹探索者
數據探索者
傳奇發電機
基因復制向導
時間樹向導

以上便是winwin7小編給大家介紹的MEGA進化樹v7.0.26 綠色中文版！