ImageJ是一款開源圖像處理軟件，最初由美國國立衛生研究院（NIH）開發，用于生物醫學圖像處理。現在已經成為生命科學和材料科學領域最常用的圖像處理軟件之一。ImageJ具有圖像處理、圖像分析、圖像顯示和圖像處理插件等功能，可以處理各種類型的圖像，包括2D和3D圖像。它可以在Windows、MacOSX和Linux等操作系統上運行，并且可以在不同的計算機平臺之間進行數據交換。ImageJ的主要特點是易于使用和靈活性。它提供了許多常用的圖像處理和分析功能，例如圖像增強、傅里葉變換、形態學操作、圖像分割、二值化和測量等。此外，ImageJ還可以通過插件進行擴展，用戶可以根據自己的需求選擇不同的插件來增強其功能。ImageJ的應用范圍非常廣泛，包括生物醫學、材料科學、地球科學、環境科學、工程學和物理學等領域。它可以用于細胞圖像分析、藥物篩選、組織學圖像分析、納米材料圖像分析、地球物理圖像處理和材料力學圖像分析等。

基本簡介

 ImageJ是一個基于java的公共的圖像處理軟件，它是由NationalInstitutesofHealth開發的。可運行于MicrosoftWindows，MacOS，MacOSX，Linux，和SharpZaurusPDA等多種平臺。其基于java的特點，使得它編寫的程序能以applet等方式分發。
 ImageJ能夠顯示，編輯，分析，處理，保存，打印8位，16位，32位的圖片，支持TIFF,PNG,GIF,JPEG,BMP,DICOM,FITS等多種格式。ImageJ支持圖像棧功能，即在一個窗口里以多線程的形式層疊多個圖像，并行處理。只要內存允許，ImageJ能打開任意多的圖像進行處理。除了基本的圖像操作，比如縮放，旋轉，扭曲，平滑處理外，ImageJ還能進行圖片的區域和像素統計，間距，角度計算，能創建柱狀圖和剖面圖，進行傅里葉變換。
 ImageJ支持圖像棧功能，即在一個窗口里以多線程的形式層疊多個圖像，并行處理。只要內存允許，ImageJ能打開任意多的圖像進行處理。除了基本的圖像操作，比如縮放，旋轉，扭曲，平滑處理外，ImageJ還能進行圖片的區域和像素統計，間距，角度計算，能創建柱狀圖和剖面圖，進行傅里葉變換。

imagej功能

 ImageJ支持用戶自定義插件和宏。ImageJ自帶編輯器，并且導入了java的編譯器，實現了簡單的IDE功能，用戶可直接基于ImageJ進行圖像處理。
 ImageJ通過Java插件被設計為開放體系結構的，可以獲取定制的分析、處理插件，這些插件都能夠使用ImageJ內置的編輯器和編譯器。用戶自定義插件可以解決幾乎所有圖像處理和分析方面的問題。
 ImageJ的源代碼免費提供。
 主面由菜單欄，工具欄和狀態欄組成。
 菜單欄包括：文件，編輯，圖形，處理，分析，插件，窗口，幫助。
 文件主要有:文件打開，關閉，保存等功能，比較特殊的一個功能是恢復功能。可以直接回到上次保存過的狀態。

ImageJ是一款功能強大、易于使用且靈活的圖像處理軟件，可以滿足不同領域的圖像處理和分析需求。