FlowJo 10是一款非常不錯的流式細胞數據分析軟件,擁有非常強大的數據處理和分析功能,通過圖像分析細胞的各種變化,結合細胞模型創建合理的數據分析平臺,支持參數導出功能,可以兼容幾乎所有流式儀器采集的數據,幫助用戶輕松了解了解細胞的狀態變化!
軟件特色
1、階梯式設門
FlowJo獨特的階梯式設門試一次革命性的創新。他一改傳統復雜的邏輯門設置,將細胞群之間的邏輯關系用簡單的遞進階梯式去呈現,并可以自定義細胞群名稱、進而直觀的現實細胞群統計值,讓分析結果一目了然,簡單清晰。
2、圖像呈現法
①多維參數顯示
FlowJo提供了靈活的數據呈現方式,全方位滿足用戶的數據分析需要。它可以呈現一維的直方圖,傳統的二維圖形,及動態立體的三維圖形,從多個角度和空間對數據進行360°的靜態以及動態解析。
②多種圖形類型
FlowJo除了提供傳統的散點圖,還提供多種圖形類型(如密度圖,等高圖,偽色圖,斑馬圖等),在滿足不同分析需求的同時還保證了圖像的美觀和科學嚴謹需求。
3、多種設門工具
設門是流失數據分析中界定細胞目標群的必要手段,不管要檢測的目標細胞群是規則分布還是不規則分布,小概率事件還是大概率事件,FlowJo提供了多種設門工具,從而讓用戶方便的界定各種細胞群。
4、強大的批量處理功能
用戶可以做一個樣品的門分析,然后將這個分析批處理應用到其他樣品上;也可以做一個樣品的圖形分析,然后將這個分析批處理用到其他樣品上。這樣避免了對每一個樣品進行重復性試驗的分析,即保證了數據分析的一致性及靈活性,同時也極大地提高了分析的效率并且得到完美的分析結果。
①門的批處理
你可以將一個樣品的門分析,批量應用到其他的樣品上。整個過程只需要輕輕拖動鼠標就可完成,非常簡單。
②圖形分析的批處理
圖像處理也可以用批量分析的方法,將一個樣品的分析應用到其他樣品上。
5、多種分析平臺及工具
FlowJo自身包含了多個特殊的分析平臺來滿足細胞周期,細胞增殖,動力學(鈣離子流量)等的分析。這些平臺采用權威的已發表的模型算法原理設計,來精確模擬數據分布。FlowJo還包含了多種獨特的分析工具,如數據聯結、衍生參數軸、校準、Backgating、Show Ancestry、Sample Comparision等,讓你對數據作進一步的深層分析及處理。
6、熒光補償
熒光補償是六十分析里面一個重要的概念也是一個復雜的過程,卻是流式分析必不可缺的部分。軟件補償一改過去在機器上手動調節補償的冗長復雜過程,大大簡化了熒光補償過程,將補償數據的過程變成一個可理解,可見的簡單過程,同時提供了在機器上手動補償所沒有的精確度和靈活性。
7、靈活方便的數據導出
數據的導出在FlowJo里面非常的輕松方便。不管是圖形數據還是數據表格,都可以方便的導出成各種格式用來做數據的分享和發表。
軟件功能
1、反向控制分析
一旦你的分析包含了門內門控產生的亞群,就可以看到一個給定亞群的源圖形。反向控制分析顯示在每個階段的圖突出最后亞群的每個門控操作圖。
2、抗體面板向導
這個逐步的工具包含了許多供應商的抗體目錄和你的流式細胞儀的配置,使抗體面板設計更精簡的過程。它有一個在線網站,fluorish.com,在那里你可以與你的核心或實驗室經理或同事聯系,得到儀器的配置,搜索組抗體,抗體和購買。
3、細胞周期分析
軟件有一個細胞周期的平臺,采用多種模型對數據進行擬合,擬合參數的約束,并自動計算在G1期,細胞的百分比,或G2期。所有的模型都可以復制到其他的人群或樣本中,使用相同的簡單的拖放界面來傳播其他的門或分析。
4、補償
污漬的光譜重疊處理補償工具在軟件。計算補償矩陣的接口是基于單染色控制樣本的集合。然后您可以將這個補償矩陣應用到多染色的樣本中。軟件增加了補償參數多染色樣品,這樣你就可以查看和分析補償數據。
5、導出參數
軟件讓你定義為樣本的新參數。這些可能包括縮放參數(擴展感興趣區域),時間參數(用于執行動力學分析),比率參數,或在log和線性縮放之間轉換的參數。派生參數定義可以復制到整個組的樣本中。
6、FCS掃描
FCS掃描工具將掃描本地或遠程文件系統的FCS文件。當你想找到符合特定條件的FCS文件(污點協議、操作員ID、運行日期、機器等),或者當FCS文件被移動并需要重新定位時,這個實用工具就很方便了。
7、影視
分析平臺獨特的軟件:查看你的數據動態。使用圖形窗口或布局編輯器電影來生成圖形作為時間的函數(動能分析),或者生成一個或兩個參數作為第三的函數的圖。這種獨特的可視化可以讓您發現數據中的微妙關系,否則將不可能看到其他的關系。
8、板編輯
一個全新的平臺進行注釋,分組和組織板基于流式細胞儀檢測數據的元數據注釋工具板,進口板材快速標注一個CSV文件,并能夠設置標注滴定。
使用教程
如果你對不同的病人做相似的實驗,你可以保存一個工作區作為一個模板,包含所有的門、統計數據、表格和布局。下周,當你和不同的病人做同樣的實驗時,大部分工作已經為你做完了!您只需將新的示例導入模板工作區即可。良好的模板設計節省了大量的軟件分析時間和標準化報表。
1、將樣本加載到工作區中。
2、為相關的示例、門等創建組。
3、詳細分析單個示例,創建門戶、統計數據等。
4、對組中的所有樣本應用適當的分析。
5、檢查組中樣品的澆口:易于修改樣品以適應樣品變化。
6、生成一個圖形布局,您可以在其中顯示所有示例中的特定圖形。
7、生成一個表,您可以在其中創建所有樣本的特定統計信息。